Das Präsidium besteht aus hauptamtlichen Präsidiumsmitgliedern, die von der Delegiertenversammlung gewählt werden. Es führt die Geschäfte des Vereins, entwickelt Strategien und Konzepte für Produkte und Dienstleistungen und setzt die von der Delegiertenversammlung beschlossenen strategischen Maßnahmen und Programme um. Dabei arbeitet das Präsidium mit Unterstützung der beiden Geschäftsstellen der GPM in Nürnberg und Berlin sowie der Zertifizierungsstelle PM-ZERT.
Prof. Dr. Peter Thuy ist seit 1. Juni 2022 Präsident der GPM Deutsche Gesellschaft für Projektmanagement e. V. Der habilitierte Wirtschaftswissenschaftler sammelte Berufserfahrung im Verlagswesen und in der Wirtschaftsprüfung und war vor seiner jetzigen Position mehr 20 Jahre als Rektor und Geschäftsführer an der IUBH (heute: IU Internationale Hochschule) tätig. Dort prägte er maßgeblich die Entwicklung von einer kleinen, spezialisierten Campushochschule zur größten deutschen Hochschule mit Programmangeboten insbesondere im Fernstudium. Darüber hinaus gehörte er zwölf Jahre dem Vorstand des Verbands Privater Hochschulen (VPH) an - davon 9 Jahre als Vizepräsident und 3 Jahre als Präsident.